Услуги по таможенному оформлению, оказываемые на основании договора, не предусматривающего организацию международной перевозки товаров, облагаются НДС по ставке 18% (письмо Минфина России от 18.04.2011 № 03-07-08/114).
При организации международной перевозки товаров с использованием нескольких видов транспорта стоимость транспортно-экспедиционных услуг в полном объеме включается в налоговую базу, облагаемую НДС по ставке 0% (письмо Минфина России от 18.04.2011 № 03-07-08/112).
Услуги по перевалке грузов, перечень которых установлен пп. 2.2 п. 1 ст. 164 НК РФ, оказанные в морском порту, подлежат налогообложению по ставке НДС в размере 0% (письмо Минфина России от 18.04.2011 № 03-07-08/113).
Вне зависимости от того, что в течение 5 календарных дней после получения предоплаты под предстоящую поставку товаров, приходящихся как на один так и на разные налоговые периоды, производится отгрузка, счета-фактуры оформляются в двух экземплярах как на сумму полученной предоплаты, так и на сумму отгрузки в счет указанной предоплаты (письмо ФНС России от 15.02.2011 № КЕ-3-3/354@).
Налогоплательщик не вправе предъявлять к вычету НДС на основании счетов-фактур, заверенных факсимильной подписью руководителя и главного бухгалтера организации (письмо УФНС России по г. Москве от 07.10.2010 № 16-15/104968@).
Транспортно-экспедиционные услуги, оказываемые на основании договора транспортной экспедиции, связанные с перевозкой товаров, ввозимых на территорию Российской Федерации с территории иностранного государства, облагаются НДС по ставке 0% независимо от вида таможенной процедуры, под которую помещаются товары (письмо Минфина России от 18.03.2011 № 03-07-08/73).
В целях применения нулевой ставки НДС к транспортно-экспедиционным услугам относятся, в том числе, услуги по оформлению товаросопроводительной, товаротранспортной документации и комплекта перевозочных документов, которые в соответствии с нормативными документами, регламентирующими порядок заключения договоров перевозки, подтверждают заключение этих договоров (письмо Минфина России от 17.02.2011 № 03-07-08/49).
При получении предоплаты в валюте НДС исчисляется по курсу Банка России, действовавшему на дату поступления денежных средств, по расчетной ставке в соответствии с п. 4 ст. 164 НК РФ. В момент отгрузки НДС исчисляется со стоимости отгруженных товаров по курсу, действовавшему на дату отгрузки. Если по условиям сделки обязательство выражено в иностранной валюте, то суммы, указываемые в счете-фактуре, могут быть выражены в иностранной валюте (письмо УФНС РФ по г. Москве от 30.09.2010 № 16-15/102343).